哈尔滨工程大学王牌专业有船舶与海洋工程、能源与动力工程、轮机工程、自动化、水声工程、计算机科学与技术、机械设计制造及其自动化、电子信息工程、工商管理、核工程与核技术、光电信息科学与工程等，算是比较好的专业了，以下是具体名单，供大家参考，如有变动，以学校最新公布信息为准。
1、一流本科专业建设点（国家级+省级）
2020年度国家级一流本科专业建设点名单：飞行器动力工程、工程力学、测控技术与仪器、电气工程及其自动化、软件工程、工业设计、材料科学与工程、数学与应用数学、社会学
2020年度省级一流本科专业建设点名单：土木工程、探测制导与控制技术、信息安全、金融学、化学工程与工艺、英语、法学、思想政治教育
2019年度国家级一流本科专业建设点名单：船舶与海洋工程、能源与动力工程、轮机工程、自动化、水声工程、计算机科学与技术、机械设计制造及其自动化、电子信息工程、工商管理、核工程与核技术、光电信息科学与工程
2019年度省级一流本科专业建设点名单：工程力学、测控技术与仪器、通信工程、港口航道与海岸工程、核化工与核燃料工程
2、国家级特色专业
| 序号 | 学校名称 | 专业名称 | 批次 |
| 1 | 哈尔滨工程大学 | 轮机工程 | 第二批 |
| 2 | 哈尔滨工程大学 | 船舶与海洋工程 | 第二批 |
| 3 | 哈尔滨工程大学 | 热能与动力工程 | 第二批 |
| 4 | 哈尔滨工程大学 | 自动化 | 第三批 |
| 5 | 哈尔滨工程大学 | 核工程与核技术 | 第四批 |
| 6 | 哈尔滨工程大学 | 测控技术与仪器 | 第六批 |
| 7 | 哈尔滨工程大学 | 信息对抗技术 | 第六批 |
3、教育部卓越工程师教育培养计划专业
| 序号 | 学校名称 | 专业名称 |
| 1 | 哈尔滨工程大学 | 测控技术与仪器 |
| 2 | 哈尔滨工程大学 | 核化工与核燃料工程 |
| 3 | 哈尔滨工程大学 | 电子信息工程 |
| 4 | 哈尔滨工程大学 | 通信工程 |
| 5 | 哈尔滨工程大学 | 环境工程 |
| 6 | 哈尔滨工程大学 | 船舶与海洋工程 |
| 7 | 哈尔滨工程大学 | 自动化 |
4、教育部专业综合改革试点专业：船舶与海洋工程、测控技术与仪器、电子信息工程、核化工与核燃料工程
5、其他
1、哈尔滨工程大学金融学专业在河南2021年高考理科招生计划人数为3人；
2、哈尔滨工程大学水声工程专业在河南2021年高考理科招生计划人数为24人；
3、哈尔滨工程大学水声工程专业在河南2021年高考理科招生计划人数为2人；
