学校有国家重点实验室5个，国家数学中心1个，国家教材建设重点研究基地1个，国家临床医学研究中心2个，国家制造业创新中心1个，教育部工程研究中心7个，教育部重点实验室14个，卫健委重点实验室9个，总后勤保障部卫生部重点实验室1个，上海市重点实验室15个，上海市工程研究中心11个；有教育部人文社会科学重点研究基地10个，中国研究院入选首批国家高端智库建设试点单位，马克思主义学院入选首批全国重点马克思主义学院，“中国大学智库论坛”秘书处落户复旦。
近年来，复旦大学同全球40多个国家和地区的270多所大学和机构签订有合作协议，师生每年出国约8000人次，每年接受海外来访人员约5000人次，每年举办国际会议约100场。
学校共有邯郸、枫林、张江、江湾四个校区，占地总面积约243.92万平方米，校舍建筑面积224.11万平方米。（数据截止日期2020年4月）
