医疗规模和实力居全国领先行列：拥有10家直属附属医院（其中7家综合医院，3家专科医院）。在复旦大学医院管理研究所发布的2019年度医院排行榜（综合）中，我校5家附属医院进入排名前100，肿瘤防治中心、孙逸仙纪念医院进入排名前50，附属第一医院进入排名第6；2019年度40个专科排行榜中，20个专科进入排名前10，6个专科进入排名前5，中山眼科中心在其专科排行榜中位列第一。孙逸仙纪念医院院长宋尔卫教授于2019年11月被增选为中科院院士。
