重庆交通大学王牌专业排名有机械设计制造及其自动化、土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输、水利水电工程、航海技术、轮机工程等，具体专业名单请参考以下表格。
1、一流本科专业建设点（国家级+市级）
| 学校名称 | 专业名称 | 等级 | 年份 |
| 重庆交通大学 | 土木工程 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 港口航道与海岸工程 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 交通运输 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 交通工程 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 机械设计制造及其自动化 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 计算机科学与技术 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 物流管理 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 工程管理 | 国家级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 数学与应用数学 | 国家级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 车辆工程 | 国家级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 材料科学与工程 | 国家级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 船舶与海洋工程 | 国家级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 旅游管理 | 国家级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 水利水电工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 建筑学 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 地质工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 工程力学 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 通信工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 测绘工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 航海技术 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 汽车服务工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 轮机工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 经济学 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 材料物理 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 英语 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 机械电子工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 电子信息工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 给排水科学与工程 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 广播电视学 | 市级 | 2019 |
| 重庆交通大学 | 环境科学与工程 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 交通设备与控制工程 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 风景园林 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 物联网工程 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 应用化学 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 工商管理 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 应用统计学 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 环境设计 | 市级 | 2020 |
| 重庆交通大学 | 飞行器动力工程 | 市级 | 2020 |
2、国家特色专业
国家级特色专业：土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输
3、教育部卓越工程师教育培养计划专业
教育部卓越工程师教育培养计划专业：机械设计制造及其自动化、土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输、水利水电工程、航海技术、轮机工程
4、其他重点专业
专业综合改革试点项目
| 级别 | 获得年份 | 专业名称 | 所属学院 |
| 国家级 | 2013 | 交通运输 | 交通运输学院 |
| 市级 | 2012 | 交通运输 | 交通运输学院 |
| 市级 | 2012 | 水利水电工程 | 河海学院 |
| 校级 | 2012 | 物流管理 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2012 | 车辆工程 | 机电学院 |
| 校级 | 2012 | 计算机科学与技术 | 信息学院 |
特色专业建设项目
| 级别 | 获得年份 | 专业名称 | 所属学院 |
| 市级 | 2007 | 土木工程 | 土木工程学院 |
| 市级 | 2007 | 港口航道与海岸工程 | 河海学院 |
| 市级 | 2007 | 交通运输 | 交通运输学院 |
| 市级 | 2008 | 交通工程 | 交通运输学院 |
| 市级 | 2008 | 工程管理 | 经济与管理学院 |
| 市级 | 2008 | 机械设计制造及其自动化 | 机电与车辆工程学院 |
| 市级 | 2009 | 材料科学与工程 | 材料科学与工程学院 |
| 市级 | 2011 | 物流管理 | 经济与管理学院 |
| 市级 | 2011 | 水利水电工程 | 河海学院 |
| 校级 | 2009 | 材料科学与工程 | 材料科学与工程学院 |
| 校级 | 2009 | 英语（涉外工程英语） | 外国语学院 |
| 校级 | 2009 | 物流管理 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2009 | 水利水电工程 | 河海学院 |
| 校级 | 2010 | 轮机工程 | 航运与船舶工程学院 |
| 校级 | 2010 | 经济学（交通经济方向） | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2010 | 电子信息工程 | 信息科学与工程学院 |
| 校级 | 2010 | 测绘工程 | 土木工程学院 |
| 校级 | 2010 | 环境科学 | 河海学院 |
“三特行动计划”建设项目
| 级别 | 项目类型 | 获得年份 | 项目名称 | 所属学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2013 | 港口航道与海岸工程 | 河海学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2013 | 土木工程 | 土木工程学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2013 | 水利水电工程 | 河海学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2013 | 交通运输 | 交通运输学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2013 | 交通工程 | 交通运输学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2013 | 材料科学与工程 | 材料科学与工程学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2014 | 工程管理 | 经济与管理学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2014 | 机械设计制造及其自动化 | 机电与车辆工程学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2014 | 车辆工程 | 机电与车辆工程学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2015 | 计算机科学与技术 | 信息学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2015 | 船舶与海洋工程 | 航运与船舶工程学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2016 | 建筑学 | 建筑与城市规划学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2016 | 地质工程 | 河海学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2016 | 通信工程 | 信息科学与工程学院 |
| 市级 | “三特”特色专业 | 2016 | 物流管理 | 经济与管理学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2014 | 土木建筑 | 土木工程学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2014 | 水利水运工程 | 河海学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2014 | 交通运输工程 | 交通运输学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2015 | 机械工程 | 机电与车辆工程学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2017 | 船舶工程 | 航运与船舶工程学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2017 | 信息技术 | 信息科学与工程学院 |
| 市级 | 特色学科专业群 | 2017 | 物流与商贸 | 经济与管理学院 |
大数据智能化类专业建设项目
| 级别 | 获得年份 | 专业名称 | 所属学院 |
| 市级 | 2018年 | 电子信息工程 | 信息学院 |
| 市级 | 2018年 | 机械设计制造及其自动化 | 机电学院 |
| 市级 | 2018年 | 机械电子工程 | 机电学院 |
专业建设提升计划与专项计划项目
| 级别 | 获得年份 | 专业名称 | 所属学院 |
| 校级 | 2010 | 市场营销 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2010 | 国际经济与贸易 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2010 | 英语 | 外国语学院 |
| 校级 | 2010 | 测绘工程 | 土木工程学院 |
| 校级 | 2010 | 艺术设计 | 马蒂亚斯国际设计学院 |
| 校级 | 2010 | 电子信息工程 | 信息学院 |
| 校级 | 2010 | 机械设计制造及其自动化 | 机电学院 |
| 校级 | 2010 | 水利水电工程 | 河海学院 |
| 校级 | 2010 | 交通工程 | 交通运输学院 |
| 校级 | 2010 | 信息与计算科学 | 数学与统计学院 |
| 校级 | 2011 | 计算机科学与技术 | 信息学院 |
| 校级 | 2011 | 物流管理 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2011 | 经济学 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2011 | 数学与应用数学 | 数学与统计学院 |
| 校级 | 2011 | 地质工程 | 河海学院 |
| 校级 | 2011 | 旅游管理 | 人文学院 |
| 校级 | 2011 | 轮机工程 | 航运与船舶工程学院 |
| 校级 | 2011 | 材料科学与工程 | 材料科学与工程学院 |
| 校级 | 2011 | 工业设计 | 马蒂亚斯国际设计学院 |
| 校级 | 2011 | 航运管理 | 交通运输学院 |
| 校级 | 2013 | 给排水科学与工程 | 河海学院 |
| 校级 | 2013 | 船舶电子电气工程 | 航运与船舶工程学院 |
| 校级 | 2013 | 视觉传达设计 | 马蒂亚斯国际设计学院 |
| 校级 | 2013 | 建筑学 | 建筑与城市规划学院 |
| 校级 | 2013 | 电气工程及其自动化 | 机电学院 |
| 校级 | 2013 | 工程力学 | 土木工程学院 |
| 校级 | 2013 | 地理信息科学 | 建筑与城市规划学院 |
| 校级 | 2013 | 应用化学 | 材料科学与工程学院 |
| 校级 | 2013 | 车辆工程 | 机电学院 |
| 校级 | 2014 | 机械电子工程 | 机电学院 |
| 校级 | 2014 | 环境科学 | 河海学院 |
| 校级 | 2014 | 船舶与海洋工程 | 航运与船舶工程学院 |
| 校级 | 2014 | 广播电视学 | 人文学院 |
| 校级 | 2014 | 信息管理与信息系统 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2014 | 风景园林 | 建筑与城市规划学院 |
| 校级 | 2014 | 材料成型及控制工程 | 机电学院 |
| 校级 | 2014 | 应用统计学 | 数学与统计学院 |
| 校级 | 2014 | 知识产权 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2014 | 翻译 | 外国语学院 |
| 校级 | 2015 | 理论与应用力学 | 土木工程学院 |
| 校级 | 2015 | 能源与动力工程 | 机电与车辆工程学院 |
| 校级 | 2015 | 人文地理与城乡规划 | 建筑与城市规划学院 |
| 校级 | 2015 | 通信工程 | 信息科学与工程学院 |
| 校级 | 2015 | 物联网工程 | 信息科学与工程学院 |
| 校级 | 2015 | 材料物理 | 材料科学与工程学院 |
| 校级 | 2015 | 工商管理 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2015 | 会计学 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2015 | 工程造价 | 经济与管理学院 |
| 校级 | 2015 | 广告学 | 人文学院 |
| 校级 | 2015 | 汉语国际教育 | 人文学院 |
| 校级 | 2017 | 城乡规划 | 建筑与城市规划学院 |
