学校拥有教育部人文社科重点研究基地1个、国家级住院医师规范化培训基地3个、国家级临床重点专科1个，省级重点实验室、工程技术研究中心、院士专家工作站等省级科研平台12个，省级一流学科6个，嘉兴市重点实验室11个。《嘉兴学院学报》为全国高校社科期刊优秀学报，“嘉兴名人与嘉兴文化”栏目入选教育部“名栏工程”。近5年,学校教师承担省部级及以上科研项目532项，其中国家级项目117项；获省部级（含一级协会）科研奖励58项，其中全国高校人文社科研究优秀成果一等奖、二等奖各1项。
学校充分发挥地处长三角一体化发展国家战略核心区优势、与有色行业联系紧密优势，主动对接长三角地区产业、企业发展需求，深入推进产教融合、校企合作，共建有亚特机电学院、阿里巴巴产学研基地等30余个校企合作育人平台，搭建有浙江省长三角一体化发展研究中心、嘉兴市大学科技园、嘉兴学院G60科创走廊产业与创新研究院、浙江（嘉兴）中外政党研究中心、嘉兴学院中国共同富裕研究院等一批科研创新载体。学校被认定为教育部—中兴通讯ICT产教融合创新基地项目第一批合作院校，2项校企合作育人成果获浙江省教学成果一等奖，61个校企合作项目被教育部认定为全国高校产学研合作协同育人项目；学校创业学院入选浙江省普通高校示范性创业学院，大学生创业实践园被评为国家级众创空间，学子2次荣获全国“挑战杯”大学生创业计划竞赛金奖；学校为浙江省应用型建设试点示范高校，连续五年在浙江省教育厅普通本科高校分类评价中列同类院校第1位，2018年获中国产学研合作促进奖。
学校充分发挥地处党的诞生地优势，以大力传承弘扬“红船精神”为己任，建有全国首个“红船精神研究中心”。嘉兴学院中国共产党革命精神与文化资源研究中心为教育部人文社科重点研究基地，浙江省中国共产党创建史研究中心为省哲学社会科学重点研究基地，浙江省红色文化研究与传承协同创新中心为省“2011协同创新中心”。学校是教育部全国高校思想政治理论课教师社会实践研修基地、浙江省*理论体系研究基地、嘉兴学院（全省教育系统）党员教育基地、浙江省重点马克思主义学院建设单位、浙江省高校二级学院党委领导下的院长负责制试点单位、浙江省高校文化校园建设首批试点单位、浙江省新时代高校思政课研学基地（嘉兴市）依托高校、浙江省“三全育人”综合改革重点支持高校。学校“红船先锋营”文化品牌获全国高校校园文化建设优秀成果一等奖，“省身文化”品牌获全国高校校园文化建设优秀成果奖，党建工作在2017年省属高校党建工作述职评议中位列第一名。学校学子先后荣获“中国青年志愿服务金质奖章”、2008-2010年连续三届“浙江骄傲”、浙江省十佳大学生、浙江省杰出志愿者、浙江省第一届感动校园人物、浙江省首届美德学子等荣誉。
当前，学校正牢记时任浙江省委书记习近平同志“努力把学校办成一所有特色、善创新的综合性大学”的殷切嘱托，大力弘扬“红船精神”，秉承“方正为人 勤慎治学”校训，践行“求是求真求正”校风，勇猛精进、追求卓越，不断提升人才培养、科学研究、社会服务、文化传承创新和国际交流合作能力，全力以赴创建嘉兴大学，建设有特色、善创新的一流应用型综合性大学。
