近年来，学校按照全面深化综合改革、注重内涵发展的要求，多措并举，积极推进教育教学改革。进一步调整优化专业结构，逐步构建了以农科为优势，农、工、经、管、理、文、法、教育多学科相互渗透、相互支撑、协调发展的学科专业框架；不断修订完善专业人才培养方案，构建多样化的人才培养模式和体系；形成国家、省、学校三个层面的三级“质量工程”体系，共获准立项质量工程项目国家级144项、省级451项；建设了课程开发系统、自主学习中心、实验教学中心、教学科研基地以及教学管理五大教学平台；获国家级教学成果二等奖1项、优秀奖1项，省级教学成果特等奖1项、一等奖11项、二等奖32项；拥有国家级教学名师、国家级精品课程、国家级实验教学示范中心、国家级人才培养模式创新实验区、国家级特色专业建设点；2005-2018年，连续14年评为云南省高校毕业生就业考评优秀，被教育部评为“2011-2012年度全国毕业生就业50所典型经验高校”“2016年度全国创新创业50所典型经验高校”，2017年被教育部认定为“全国深化创新创业教育改革示范高校”，被国务院授予“全国就业工作先进单位”荣誉称号。
学校先后承担联合国全球环境基金、欧盟项目、国家重点研发计划、国家973计划、863计划、科技支撑计划、公益性行业科研专项、国务院农改办、国家基金重点项目等各级各类项目3480余项，科研经费达13亿元，获国家技术发明二等奖、国家科技进步二等奖、联合国粮农组织（FAO）科学研究一等奖、国际农业研究（CGIAR）杰出科学奖、何梁何利科学技术进步奖、云南省科学技术杰出贡献奖、云南省科技进步特等奖等国际、国家及省部级奖励455项。审定登记滇撒猪配套系、龙陵黄山羊、武定乌骨鸡、水稻、玉米、马铃薯、小麦、甘蔗、大豆、蔬菜、花卉、药用植物、牧草等动植物新品种（系）165个。发表论文27107篇，其中SCI、EI、CPCI-S等论文4197篇。获授权专利1177件，其中发明专利281件。同时，学校立足云南生物资源优势，围绕省委省政府重大战略目标和“三农”发展需求，致力于重大科学问题理论创新、产业关键技术研发、产学研相结合与农科教一体化的社会服务体系机制创新，为高原特色现代农业产业发展提供人才科技和智力支撑。其中，朱有勇院士团队创建了农业生物多样性控制病虫害理论与技术，研究成果在《Nature》作为封面文章发表，在国内大面积推广应用累计达3.02亿亩，突破作物品种单一化种植重大难题，成为世界上利用生物多样性控制病虫害的成功典范，获国家科技进步二等奖、国家技术发明二等奖等奖励；李铮友教授等率先育成中国第一个水稻雄性不育系，并首先实现我国杂交粳稻“三系”配套，获全国科学大会奖，创造了杂交粳稻单产1108.55千克的世界纪录，率领团队育成品种40多个，累计推广3000多万亩；盛军教授团队围绕茶叶等特色生物资源，通过建立茶树基因组数据库，系统阐释了茶树起源、演化以及茶树基因迁徙规律，阐明普洱茶降血脂、降血糖、减缓糖尿病并发症机理，开发普洱茶系列深加工产品，发掘辣木、铁皮石斛、玛咖等新资源，实现了创新引领产业升级发展；魏红江教授团队构建基因编辑和体细胞克隆技术，与美国合作获得了世界第一批内源性逆转录病毒失活克隆猪，并在《Science》上以封面文章发表，同时获得了人类系统性红斑狼疮、杜氏肌营养不良症、侏儒症等多种小型猪疾病模型。
学校坚持走中国特色科教兴农之路，高度重视科技成果转化和推广，大力推进校地、校企间合作，逐步形成以服务“三农”为主体，多项社会服务工作并重的“一体多点”科技服务格局，社会服务工作成绩显著。学校与昆明、普洱、文山、德宏、迪庆、大理等10余个州（市），与670多家企业签订合作协议，建立了全方位、深层次、宽领域的合作关系；多年开展“3+3”校县联合行动，大力扶持当地发展优质、高产、高效现代农业；深入“八县一乡”开展扶贫，以产业扶贫、科技扶贫为核心结对帮扶姚安县前场镇木薯村、南华县沙桥镇新华村，持续帮扶16年的姚安县于2018年顺利脱贫，加挂帮扶澜沧县成效显著并被中央电视台等9家新闻媒体集中报道；发挥国家级新农村发展研究院、云南省高原特色农业产业研究院、云南农村干部学院、云南省食品安全管理学院和中国—东盟教育培训中心、教育部财政部认定的优质省级职教师资培养培训基地、云南省现代农业技术培训基地优势和作用，积极探索建立以大学为依托、农科教相结合、教科推一体化和社会服务国际化的科技服务新模式。学校连续七年被省委、省政府表彰为“年度社会扶贫先进集体”。2018年，我校报送的《厚植科技资源 助力产业扶贫》入选教育部“省属高校精准扶贫精准脱贫20个典型项目”。
先后与英国、美国、日本、德国、韩国、法国、比利时、荷兰、加拿大、澳大利亚、新西兰、泰国、越南、老挝、缅甸、斯洛文尼亚等23个国家75所院校建立了交流合作关系。1987年开始，与英国胡弗汉顿大学开展科研合作，联合培养博士研究生；2014年获批 “土木与环境工程”中外合作办学项目；1997年获批招收来华留学生，2014年成为中国政府奖学金接收外国留学生院校；2001年开始，与荷兰劳伦斯坦大学开展“2+2”联合培养本科生项目；2012年外交部和教育部批准 “中国-东盟教育培训中心”在我校挂牌，承办各部委或国际组织委托的援外农业科技国际培训；2015年获批与新西兰林肯大学开展了“农林经济管理专业”中外合作办学项目；长期与越南、泰国、缅甸各大学开展“2+1+1”联合培养越南语、泰语、对外汉语专业本科生；与云天化等知名企业合作开展“校企协同国际育人”等项目，推动了社会服务的国际化。先后主持GEF、EU、ADB、IRRI等资助的20余项国际科技合作项目，享有良好的国际声誉。
学校牢固树立“育人为本，德育为先”观念，齐抓共管精神文明和校园文化建设，积极构建“三全育人”体系，大力*。涌现出全国优秀共产党员、全国师德先进个人、全国十大“三农”人物、全国民族团结先进个人、云南省兴滇人才、云南省十大杰出青年、省部级劳模等100余人。涌现出中共十六大、十七大、十八大代表1人，全国人大常委1人。培养出全国道德模范、见义勇为英雄大学生杨继斌；全国大学生百名自强之星刘艳华；全国百名优秀大学生胡颖；全国残疾人运动会马拉松比赛冠军韩桂明；首届全国城市电视台业余主持人大赛最佳主持人刘亚萍；全国新丝路杯模特大赛云南赛区冠军徐靖；全国农村青年致富带头人濮玉涛；云南省“五四”青年奖章获得者、大学生村官张学凤等优秀大学生。大学生暑期“三下乡”社会实践活动连续17年受到团中央表彰，校男子篮球代表队连续多年获云南省高校篮球比赛冠军。学校获全国高校校园文化建设优秀成果奖，被评为全国精神文明建设工作先进单位和云南省德育先进单位，云南省文明学校、云南省文明单位和昆明市文明单位称号。
