南京农业大学王牌专业有金融学、社会学、生物科学、农业机械化及其自动化、食品科学与工程、农学、园艺、植物保护、种子科学与工程、农业资源与环境、动物科学等，算是比较好的专业了，以下是具体名单，供大家参考，如有变动，以学校最新公布信息为准。
1、一流本科专业：
2020年度国家级一流本科专业建设点
| 序号 | 专业 |
| 1 | 生物技术 |
| 2 | 农业电气化 |
| 3 | 食品质量与安全 |
| 4 | 水产养殖学 |
| 5 | 草业科学 |
| 6 | 会计学 |
| 7 | 农村区域发展 |
| 8 | 行政管理 |
2020年度省级一流本科专业建设点
| 序号 | 专业 |
| 1 | 国际经济与贸易 |
| 2 | 应用化学 |
| 3 | 人文地理与城乡规划 |
| 4 | 生态学 |
| 5 | 风景园林 |
| 6 | 动物药学 |
| 7 | 信息管理与信息系统 |
2019年度国家级一流本科专业建设点
| 序号 | 专业名称 | 类别 |
| 1 | 金融学 | 国家级 |
| 2 | 社会学 | 国家级 |
| 3 | 生物科学 | 国家级 |
| 4 | 农业机械化及其自动化 | 国家级 |
| 5 | 食品科学与工程 | 国家级 |
| 6 | 农学 | 国家级 |
| 7 | 园艺 | 国家级 |
| 8 | 植物保护 | 国家级 |
| 9 | 种子科学与工程 | 国家级 |
| 10 | 农业资源与环境 | 国家级 |
| 11 | 动物科学 | 国家级 |
| 12 | 动物医学 | 国家级 |
| 13 | 农林经济管理 | 国家级 |
| 14 | 土地资源管理 | 国家级 |
2019年度省级一流本科专业建设点
| 序号 | 专业 |
| 1 | 英语 |
| 2 | 水产养殖学 |
2、国家级特色专业
| 序号 | 学校名称 | 专业名称 |
| 1 | 南京农业大学 | 农学 |
| 2 | 南京农业大学 | 动物医学 |
| 3 | 南京农业大学 | 农林经济管理 |
| 4 | 南京农业大学 | 植物保护 |
| 5 | 南京农业大学 | 农业资源与环境 |
| 6 | 南京农业大学 | 土地资源管理 |
| 7 | 南京农业大学 | 动物科学 |
| 8 | 南京农业大学 | 食品科学与工程 |
| 9 | 南京农业大学 | 园艺 |
| 10 | 南京农业大学 | 生物科学 |
| 11 | 南京农业大学 | 农业机械化及其自动化 |
3、其他重点专业：
