学院设有24个教学及教辅机构，设有本科专业25个，涵盖了医学、理学、工学、管理学、法学等5个学科门类。其中，精神医学、护理学专业为国家级一流本科专业建设点，临床医学、精神医学、药学、护理学、临床药学、预防医学等6个专业为省级一流本科专业建设点。拥有省级精品在线开放课程、省级线上线下混合式一流本科课程8门，省级实验教学示范中心、省级人才培养创新实验区3个，省级教学团队、省级教育科学A类研究团队、省高校虚拟教研室4个。学院通过了教育部临床医学专业认证、护理学专业认证、本科教学工作审核评估。
学院拥有医学技术、基础医学2个硕士授权一级学科，药学、临床医学、公共卫生、护理、应用心理5个硕士专业学位类别。拥有省级重点学科、省级领军人才梯队、市级领军人才梯队等27个；设有省重点实验室、省工程技术研究中心、省技术转移示范机构、省校企共建工程技术中心、省高校重点实验室、博士后科研工作站、院士专家工作站、齐齐哈尔医学科学院、卫生检验中心等科研机构。近年来，学院获得各类科研项目1144项，获各种奖励297项。主办《中华现代护理杂志》《神经疾病与精神卫生》《齐齐哈尔医学院学报》，均为国内公开发行。
学院拥有4所直属附属医院、7所非直属附属医院和直属临床病理诊断中心，另有29所教学医院、100个实习基地，附属医院编制床位14600张，能够很好地满足临床教学和生产实习需要。近年来，学院大力推进学术型医院建设，深入实施医教协同，全面促进附属医疗机构医教研一体化发展。三所直属附属医院均为三级甲等医院，已获批成为国家级住院医师规范化培训基地、国家临床药师培训基地，国家呼吸与危重症医学科(PCCM)规范化认证医院、国家级肿瘤（消化系统）多学科诊疗试点医院，中国肺癌防治联盟肺结节诊治分中心、国家呼吸系统疾病临床医学研究分中心，国家标准版胸痛中心认证单位、国家标准化代谢性疾病管理中心认证单位、全国第一批乳腺癌规范诊疗质量控制试点中心、第六批中国心衰中心建设单位。
学院深化对外交流与合作，先后与俄罗斯、美国、日本、澳大利亚、马来西亚、印度等十余个国家及台湾、香港地区的知名高校、医疗机构建立友好关系, 开展国际合作与学术交流，并获批招收培养“来华留学黑龙江省政府奖学金生”资质。
近年来，学院秉承“大学至善、大医精诚、崇尚学术、追求卓越”的办学理念，弘扬“自强不息、甘于奉献”的齐医精神，教学、科研、医疗、管理等各项工作呈现出蒸蒸日上的发展局面。
