根据济宁医学院最新招生计划数据查询，济宁医学院开设专业有制药工程、生物制药、护理学、护理学、药物制剂、中药学、药学、药学(临床研究与应用方向)、临床药学、计算机科学与技术(智能AI)等，具体完整专业名单见下表。
| 院系设置 | 所有专业 |
|---|---|
| 医药工程学院 | 制药工程，生物制药 |
| 护理学院(济宁校区) | 护理学，护理学 |
| 药学院(日照校区) | 药物制剂，中药学，药学，药学(临床研究与应用方向)，临床药学 |
| 医学信息工程学院(日照校区) | 计算机科学与技术(智能AI)，计算机科学与技术，计算机科学与技术(惠普软件测试方向)，计算机科学与技术(健康大数据方向)，生物医学工程(医疗器械方向)，计算机科学与技术(物联网工程方向)，医学信息工程，计算机科学与技术(软件外包方向)，信息管理与信息系统(医学信息方向)，计算机科学与技术(惠普软件开发方向) |
| 精神卫生学院(济宁校区) | 精神医学，应用心理学 |
| 公共卫生学院(济宁校区) | 预防医学，卫生检验与检疫，食品质量与安全 |
| 临床医学院(济宁校区) | 临床医学 |
| 康复医学院(济宁校区) | 康复治疗学 |
| 中西医结合学院(济宁校区) | 临床医学(全科医学方向)，中西医临床医学，针灸推拿学 |
| 法医学与医学检验学院(济宁校区) | 医学检验技术，法医学，医学检验技术 |
| 口腔医学院(济宁校区) | 口腔医学 |
| 管理学院(日照校区) | 公共事业管理，劳动与社会保障，市场营销，公共事业管理(医院财务方向) |
| 生物科学学院(日照校区) | 生物工程，生物技术 |
| 外国语学院(日照校区) | 英语(跨境电子商务方向)，英语(医药英语方向) |
| 基础医学院 | 法医学 |
| 第二临床医学院 | 临床医学 |
济宁医学院创建于1952年，是山东省属普通本科高等医科院校。学校现有济宁太白湖校区、任城校区和日照校区，占地总面积115万平方米，建筑面积67万平方米，与济宁国家高新区共建教学科技园。学校固定资产总值17.3亿元，其中教学科研仪器设备总值2.5亿元，馆藏图书总量为360余万册。
学校建有2所直属附属医院，16所非隶属附属医院，170余个实践教学基地。济宁医学院附属医院为山东省区域医疗中心，固定资产总值20亿元，编制床位3100张，通过国际医院信息化（HIMSS）六级认证。附属山东省精神卫生中心为山东省唯一一家省级三级甲等精神卫生专科医院，编制床位750张。学校建有山东省医学院校唯一一个省高校司法鉴定中心，并通过国家实验认证和资质认定二合一评审。
学校现有教职工6165人。有国家级和省级教学名师、优秀教师、“泰山学者”海外特聘专家、享受国务院政府特殊津贴专家、劳动模范、五一劳动奖章获得者、有突出贡献的中青年专家等90余人；有中华医学会行为医学分会主任委员、中国行为医学领域首席科学传播专家、“国际行为医学会终身成就奖”获得者、山东省法医专业委员会主任委员、山东省医学会行为医学分会主任委员、教育部教学指导委员会委员等8人；有博士、硕士研究生导师170余人。
学校面向全国28个省（市、区）招生。现有全日制在校生16732人。普通本专科毕业生就业率保持在96 %以上，研究生考取率位于同类院校前列。
学校有基础医学院、临床医学院等19个教学单位，设有临床医学、预防医学、法医学等33个本科专业，已形成以医学教育为主体，涵盖医、理、工、管、文五个学科门类，本科教育、研究生教育、继续教育、留学生教育、中外合作办学协调发展的多层次办学格局。
学校有国家级特色专业建设点、综合改革试点项目、卓越医生教育培养计划4项；省级特色专业、应用型人才培养专业发展支持计划项目、高水平应用型重点建设专业、卓越工程师教育培养计划等项目12项；有国家级示范中心、国际合作实验室4个；省级重点学科和重点实验室、实验教学示范中心、人才培养模式创新实验区、教学团队等23个；国家级精品课程、精品资源共享课、省级精品课程等34门；拥有临床医学硕士专业学位授权点。
中华医学会行为医学分会和山东省行为医学专业委员会挂靠学校，主办《中华行为医学与脑科学杂志》《中华诊断学电子杂志》和《济宁医学院学报》，均向国内外公开发行。《中华行为医学与脑科学杂志》为中国权威学术期刊，名列基础医学类期刊第一名，并入选“中国科协精品科技期刊工程项目”。
学校坚持“为国家育人才，为大众谋健康”的办学宗旨，秉承“明德、仁爱、博学、至善”的校训，弘扬“求精、求是”的校风，薪火相传，矢志不渝，不懈奋斗，形成了“诲人不倦”的教风和“学而不厌”的学风。紧紧围绕建设“特色鲜明、国内知名的应用型现代医药科技大学”的宏伟目标，致力于培养“品德高尚、业务精湛、身心健康”的应用型人才，为国家和社会输送了大批专门人才。
