学校有2所直属附属医院，开放病床2249张，年门诊量191万余人次，年住院患者近8万人次，年手术量2.7万台次，是桂北及周边地区的医疗中心。桂林医学院附属医院为国家综合性三级甲等医院，为全国卫生系统先进集体、全国综合医院中医药示范单位、全国首批“百姓放心示范医院”、广西十佳医院、国家药物临床试验基地、卫生部指定的国际紧急救援中心网络医院和国际SOS急救中心、亚洲紧急救援中心定点医院、广西临床病理质量控制中心和广西桂林临床病理诊断中心，建有全国县级医院血液净化培训基地、广西首家微创技术培训基地、“省级美刀手术培训基地”。桂林医学院第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救等为一体的三级综合性医院，设有广西唯一独立的脑血管病(脑卒中)诊疗专科，是国家爱婴医院、自治区文明单位。
学校成立广西桂林医学院教育发展基金会，接受学校教职员工、广大校友、企事业单位和社会团体的捐赠，用于支持和推进学校教育事业的发展。其中，学校1973级校友、中国上市公司董事长蒋仁生以个人名义捐资5000万元建设新校区图书馆，是学校乃至广西高校迄今为止金额最大的单笔捐款，该项捐款被列入《2014中国捐赠百杰榜》。
学校积极开展国际交流与合作，先后与美国、澳大利亚、越南、泰国等10个国家和地区的29所高校或机构建立了校际友好与合作交流关系。
当前，桂林医学院以深化教育综合改革为契机，全面提高教育教学质量、科研水平和社会服务能力，正朝着“特色鲜明，在国内外有良好声誉的医科大学”的目标努力奋斗。
