学校注重内涵提升，现已发展成为一所以医学、理学、工学三大学科门类为主，促进医工、医理、医文、医管、医法等学科交叉融合，办学特色和优势较为突出的江西省“双一流”建设高校，现有本科专业31个，其中国家特色专业2个（临床医学和麻醉学），国家级一流本科专业建设点2个（临床医学、护理学），江西省一流本科专业8个（临床医学、应用心理学、药学、护理学、麻醉学、医学影像学、医学影像技术、预防医学）；有江西省一流学科1个（临床医学）；有硕士学位授权一级学科5个（临床医学、基础医学、药学、医学技术、生物医学工程），有硕士专业学位授权点5个（临床医学、护理、公共卫生、应用心理、生物与医药）；有教育部、卫生部卓越医生教育培养计划等部级项目2项，教育部专业综合改革试点项目1项，国家临床教学培训示范中心1个，国家级大学生校外实践教育基地1个；教育部课程思政示范课程1门，有省卓越医生教育培养计划、省精品资源共享课、省高校精品课程等省部级各类本科教学工程项目98项。
学校拥有良好的教学科研条件，有心脑血管疾病防治教育部重点实验室1个；有中央苏区医疗卫生史与健康中国战略研究中心、江西省脑血管药理重点实验室、江西省医用组织工程材料与生物制造重点实验室等省级科研平台17个；有国家中药现代化工程技术研究中心客家中医药资源研究分中心、国家老年疾病临床医学研究中心赣南分中心各1个；省高校重点实验室2个、省高校人文社科重点研究基地1个；市级科研平台23个。直属附属医院3所（第一附属医院为全国首批74家国家临床教学培训示范中心之一），非直属附属医院8所。学校2007年通过教育部本科教学工作水平评估，2013年全国首批第13家通过教育部本科临床医学专业认证，2018年通过教育部本科教学工作审核评估，2019年通过教育部临床医学专业延长期认证，有效期延长至9年。截至2020年，学校临床医学专业毕业生执业医师资格考试通过率连续15年高出全国平均水平。
学校为区域卫生与健康事业和经济社会发展服务，在心脑血管疾病发病机制、流行特征、诊疗新技术、急救与术后管理、防治缺血性心脑血管疾病新靶标，干细胞研究与临床转化，肠道炎症和癌症及代谢性疾病的免疫学机制，分子病理检测技术，血管瘤及脉管畸形诊疗技术，泌尿外科微创技术，医药大数据，精准医学研究，老年医学与老年康复学，骨与关节退化性疾病，稀土对环境与人体健康的影响，油茶医药保健及功能产品开发，赣南特色中草药的研究与开发，中央苏区医疗卫生史与健康中国战略研究等领域形成了自身特色与优势，取得了一批标志性成果，论文在国际顶尖刊物《Cell》《European Urology》《Nature Communications》发表，近年来承担国家基金项目170余项。有国家科技进步奖1项，卫生部科技进步奖1项，国家科学委员会科技进步奖1项，省自然科学奖13项，省科技进步奖14项，省社会科学优秀成果奖10项,省创新争先奖1项；授权专利191项，其中发明专利22项，实用新型专利169项。迄今，为社会培养输送了各级卫生健康人才9万余人，成为百姓的健康守护人，为卫生健康事业发展作出了重要贡献。2020年初，积极响应号召，学校3个附属医院先后分6批次选派115名医护人员奔赴武汉、随州抗击疫情一线，为全国打赢疫情防控阻击战贡献了智慧和力量。
学校是“一带一路”国际医学教育联盟成立理事单位，重视对外合作与交流，多渠道、多途径培育和开展教育合作项目，积极开展了学分互认、学生交流、出国实习、出国访学等各类师生海外交流项目。深化与美国、英国、德国等多个国家（地区）的20余所高校、科研机构的交流合作关系。赣南医学院第一附属医院成为美国林肯纪念大学临床教学基地,学校在美国林肯纪念大学建立了师生培训基地，与德国心脏中心（柏林）互为协作单位。2005年开始招收来华留学生，毕业生中85%获得所在国执业资格，培养质量得到生源国的好评。2018年，学校培养的巴基斯坦籍留学生参加该国执业医师考试通过率达70%，远超该国35%的平均通过率，其中1人名列全国第一。2007年开始向英国、澳大利亚、日本、韩国、印度和菲律宾等国家派遣留学生和毕业生。主办了中德医院管理论坛、国际血管瘤论坛、梅奥医院管理论坛等项目。附属医院多名医生赴突尼斯开展国际医疗援助，促进了人类卫生健康共同体建设。
迈入新时代，学校将继续弘扬“艰苦奋斗，科学求是”的办学传统，恪守“立德立行，求是求新”的校训精神，着力实施“人才强校、质量提升、学科建设、科技创新、校园环境改善”五大工程，为造就德技双馨的良才，办好人民满意的医科大学不懈奋斗！
