学校加强与国内外高校、科研院所的合作和学术交流。2010年教育部启动团队式对口支援工作，中国农业大学、浙江大学、华中农业大学、北京化工大学、东华大学团队式对口支援学校取得显著实效，与西北农林科技大学、东北农业大学、兰州大学、武汉大学、南京农业大学等高校建立了紧密的合作关系，与中国农科院“十一所一院”建立了全方位实质性合作关系。与20余所国（境）外高校建立了交流合作关系。与新疆各地州、县和兵团各师、农牧团场紧密联系，走产、学、研相结合的道路，积极开展科技服务扶贫，“百名科技特派员、千名学生下基层”团队和20多个科技服务专家团队常年活跃在南疆基层，为农牧民脱贫增收发挥了特殊作用。每年组织“万名学生三下乡”社会实践活动。长期为南疆中小学教师和基层干部开展双语培训。
在新的历史时期，学校将站在新起点，勇担新使命，谋划新发展，强化为党育人、为国育才的导向，全面贯彻党的教育方针，落实立德树人根本任务，加快兵团特点、南疆特色高水平大学建设，大力培养爱国爱疆、担当奉献的*者和接班人，为实现新疆工作总目标作出新的更大贡献。
