农业工程专业是以水文学和水力学及工程力学为基础，研究利用灌溉排水工程措施调节农田水分状况和改变区域水情分布，消除水旱灾害，科学利用水资源，为发展农业生产和改善生态环境服务的综合性学科。
随着社会经济进步和科学技术发展以及水危机的日益加剧，我国的农业工程学科已经由过去的以农业生产服务为中心内容，扩展到了城市供水、城市绿地灌溉、城市污水处理及防洪、城市喷泉设计、跨流域调水、水利现代化、生态环境建设与保护等诸多领域。
中国农业大学(排名第1)、浙江大学(排名第2)、江苏大学(排名第3)、吉林大学(排名第4)、东北农业大学(排名第5)、华南农业大学(排名第6)、西北农林科技大学(排名第7)、河海大学(排名第8)、南京农业大学(排名第9)、河南农业大学(排名第10)。
农业工程专业主修课程《农业微生物学》、《农业气象学》、《植物生物技术导论》、《农业生态学》、《植物生理与生物化学》、《遗传学》、《植物生理学实验》、《作物栽培与耕作学》、《育种学》、《农业经济管理》部分高校按以下专业方向培养：功能农业、观光农业、都市型现代农业、农产品加工与营销。
农业工程专业主要研究作物生产、作物遗传育种、种子生产、经营管理等方面的基本知识和技能，进行农作物的栽培与耕作、农作物转基因育种、种子生产与检验、农产品加工与营销等。例如：玉米的人工授粉，水稻的栽培与育种，玉米、花生等农作物加工成食用油，农场的经营与管理等。
