学校设有200多个研究机构，其中，国家级协同创新中心2个（牵头单位），国家重点实验室4个，国家工程技术研究中心1个，国家工程实验室1个，国家地方联合工程研究中心2个，国家地方联合工程实验室 3个，国家研究院1 个，国家产教融合创新平台1个，国家野外科学观测研究站1个，教育部重点实验室５个，教育部工程研究中心3个，教育部野外科学观测研究站1个，教育部人文社科重点研究基地5个。近5年，学校自然科学科研实力大幅提升，在《科学》《自然》《细胞》上发表论文12篇；获国家自然科学二等奖3项，何梁何利基金科学与技术进步奖1项；6人获“全国创新争先奖”，3人获“中国青年科技奖”，3项成果获中国专利优秀奖。学校人文社会学科研究实力雄厚，近五年共承担国家社科基金重大项目34项，教育部哲学社会科学研究重大课题攻关项目7项；18项成果获教育部第八届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学），其中一等奖１项；在台湾研究、南洋研究、高等教育研究、经济研究、会计研究、南海研究等领域已经形成特色，实力雄厚。
学校对外交流与合作深入开展，已与境外250多所高校签署了校际合作协议，与51所世界排名前200名的高校开展实质性交流合作。学校积极参与汉语国际推广工作， 已与北美洲、欧洲、 亚洲、非洲等地区的大学合作建立了15所孔子学院，并获批建设“孔子学院院长学院”。在对台交流方面，已成为台湾研究的重镇和两岸学术、文化交流的前沿。2014年7月，厦门大学马来西亚分校奠基，成为中国首个在海外建设独立校园的大学，被中央媒体誉为镶嵌在“一带一路”上的一颗明珠；已开设16个专业，在校生5000余人、教职员工360余人，专任教师拥有博士学位的比例80%以上。2017年金砖国家领导人厦门会晤期间，学校成功举办“美好青春我 做主”艾滋病防治宣传校园行——走进厦门大学活动与第二届联合国教科文组织女童和妇女教育奖颁奖仪式，展示中国形象、福建成就、厦门魅力、厦大风采，受到各方高度肯定。
学校拥有完善的教学、科研设备和公共服务体系。目前，学校共有三个校区和一个海外分校。拥有纸质图书馆藏451万册、电子馆藏885万册，固定资产总值126亿元，仪器设备总值46亿元。校园高速信息网络建设的规模、水平居全国高校前列并成为CERNET2的核心节点之一。厦大校园依山傍海、风光秀丽，已成为公认的中国环境最优美的大学校园之一。
中共厦门大学第十一次代表大会进一步深化了厦门大学创建世界一流大学的奋斗目标：在建校百年之际，全面建成世界知名高水平研究型大学；在新中国成立百年之际，跃居世界一流大学前列。2021年4月6日，厦门大学迎来100周年华诞。迈进新百年，厦门大学将持续探索中国特色世界一流大学建设之路，努力为实现中华民族伟大复兴的中国梦作出新的更大贡献。
