“十三五”以来，学校承担各级各类科研项目2073项。其中，国家自然科学基金项目116项，国家社科基金项目2项。荣获自治区科学技术奖137项（一等奖8项、中青年科技创新奖6项、二等奖51项、三等奖72项）；自治区哲学社会科学优秀成果政府奖10项（一等奖1项、二等奖3项、三等奖6项）。获得自治区教学成果奖18项（一等奖6项、二等奖8项、三等奖4项）。获得国家专利授权234项。其中，发明专利34项、实用新型专利172项、外观设计专利7项、软件著作权21项。学校主办的《内蒙古医科大学学报》被教育部科技司评为“中国高校特色科技期刊”，被中国科学技术信息研究所确定为“中国科技论文统计源期刊”；出版的《疾病监测与控制》是中华预防医学会系列杂志。
学校一贯坚持开放办学方针，重视与国内外高校的交流与合作。与北京大学医学部、北京中医药大学、首都医科大学、天津中医药大学等高等院校建立了长期的合作关系；与日本、蒙古国、美国、俄罗斯、泰国、澳大利亚和奥地利等国家和地区的多所医药院校或科研单位开展了多层次、多领域的交流与合作。
内蒙古医科大学作为一所地方高等医药院校，始终坚持*，全面贯彻党的教育方针，遵循医学高等教育发展规律，以服务民族自治地方医药卫生事业，办人民满意的医学高等教育为己任，主动适应内蒙古自治区经济社会发展需要，以培养高素质医药卫生人才为根本任务，以一流学科建设为抓手，秉承“博学、尚行、精诚、至善”的校训，不断实现学校教育事业的科学发展。
