主要著述：
潘懋元主编，《高等教育学讲座》，人民教育出版社，1983、1985、1993
潘懋元主编，《高等教育学》，人民教育出版社，福建教育出版社，1984
潘懋元主编，《东南亚教育》，江苏教育出版社，1988
《潘懋元高等教育学文集》，新华出版社，1991
潘懋元（第一作者），《新加坡国立大学》，湖南教育出版社1993
潘懋元主审，《高等学校教学改革的理论研究》，云南教育出版社，1993
潘懋元（第一编者）：《中国近代教育史资料汇编－高等教育》，上海教育出版社，1993
潘懋元主编，《高等教育论文集》，厦门大学出版社1994
潘懋元（第一主编），《高等教育学》，福建教育出版社，1995
潘懋元主编，《高等学校教学原理与方法》，人民教育出版社，1995
潘懋元（第一主编）：《高等学校文理基础学科课程与教学改革研究》，厦门大学出版社，1996
潘懋元主编，《新编高等教育学》，北京师范大学出版社，1996、2009
《潘懋元高等教育学文集》，汕头大学出版社，1997、1999
《潘懋元论高等教育》，福建教育出版社，2000
潘懋元主编，《多学科观点的高等教育研究》，上海教育出版社，2001
潘懋元主编，《中国高等教育百年》，广东高等教育出版社，2003
潘懋元著，《高等教育：历史、现实与未来》，人民教育出版社，2004
潘懋元主编，《中国高等教育发展的宁波模式：博士论文篇》，浙江人民出版社，2004.
潘懋元主编，《高等教育大众化的理论与政策》，福建教育出版社，2004
